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本文一網打盡!推薦結直腸癌基因檢測有哪些?如何指導個性化用藥!

前言

結直腸癌是消化道腫瘤高發的腫瘤,結直腸癌的治療包括手術、化療,當然也包括靶向治療,所以,今天咱們來聊一聊結直腸癌的基因檢測。

了解小娘子的朋友們都知道,一般我是不推薦腫瘤患者做基因檢測的,尤其是沒有什么意義的基因檢測,除了為患者省錢,也是從治療角度考慮,沒有指導治療意義的檢測我基本不推薦。

但是指南里和治療手段包括靶向治療的,我一般都會支持基因檢測。比如肺癌、卵巢癌,結直腸癌也一樣,目前針對結直腸癌患者不同基因突變的靶向藥物也越來越多,基因檢測已經成為靶向治療前標準的步驟。

每個結直腸癌患者都具有各自的遺傳學背景,它的發生、發展、浸潤、轉移是一系列分子基因參與、多步驟調控的極其復雜的機制,此過程常與細胞失控性增殖、逃脫凋亡有關,包括原癌基因激活(常見有C-myc基因、Ras基因及EGFR等)、錯配修復基因突變(HMSHI、HLH1、PMS1、PMS2、GTBP)、抑癌基因失活(常見有p53基因、DCC基因、APC基因等)以及一些危險修飾基因(如COX-2、CD44等)。

隨著靶向治療藥物的應用(抗EGFR的單克隆抗體——西妥昔單抗和帕尼單抗),HER2、NTRK和POLD1 等基因的突變被發現可能會影響到抗EGFR單克隆抗體的療效。NCCN推薦西妥昔單抗和帕尼單抗用藥前需要進行基因檢測。

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結直腸癌基因檢測和靶向治療的開端,得益于“CRYSTAL研究”,此研究奠定了“KRAS基因”成為結直腸癌患者抗EGFR靶向治療前必須檢測的首個分子標記物,開啟了結直腸癌基于分子亞型靶向治療的里程碑,隨后BRAF、微衛星不穩定MSI/錯配修復基因MMR(MSI/MMR)、PIK3CA等基因跟上靶向治療的步伐。

在NCCN或CSCO指南中已有明確規定:腸癌常檢測的基因有:MSI/MMR、RAS和BRAF三個,并推薦腸癌確診之時就要做MSI/MRR的檢查,若是轉移性、或復發性腸癌需要做RAS、BRAF突變的檢測

一、常規基因檢測

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KRAS基因

RAS基因是一個大家族(HRAS,NRAS,KRAS),大約40%~60%的腸癌具有這類基因的突變,其中以KRAS突變最多,大約40%左右。KRAS屬于RAS基因中的一員,編碼GTP/CDP結合蛋白,其作為EGFR下游信號通路的重要效應分子,主要激活RAF-MAPK通路進行后續信號轉導,參與細胞的生長調控,在抗細胞調亡,介導腫瘤侵襲和轉移,乃至腫瘤引起的新血管生成中起作用。結直腸癌中約32%~40%的患者存在KRAS基因突變,存在KRAS突變的患者中約85%~90%的突變集中在第2號外顯子的12、13密碼子上,其余突變中約5%發生在61密碼子上,5%發生在146外顯子上。

其他的RAS突變包括KRAS3、4號外顯子及NRAS的2、3、4外顯子,突變率約為16.7%~23.4%。

CRYSTAL、TRICOLORE、FIRE-3、PRIME、PEAK等研究均表明:西妥昔單抗在KRAS外顯子2野生型患者遠期生存均獲益。因此,結腸直腸癌中KRAS基因的突變狀態對靶向治療的選擇有著決定性的作用。

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BRAF基因

BRAF是RAS家族最主要的成員。RAF是RAS基因編碼通路的下游基因,RAF激活對多種腫瘤的發生、發展產生重要影響,RAF突變以BRAF常見,BRAF是RAS-RAF-MAPK信號通路的重要基因,BRAF突變常見于V600E位點,其在結腸癌的突變率為2.5%~20%

  • BRAF突變常發生在右半結腸,大約95%的BRAF基因突變都發生在右半結腸,并且BRAF基因突變和位置有顯著的線性相關關系,隨著腫瘤位置由升結腸移至直腸,BRAF的突變率由40%降至不到2.3%。

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  • BRAFV600E與KRAS突變有些共同之處,但與KRAS基因突變相比,BRAF突變型惡性程度高、組織級別高、淋巴結轉移率和局部晚期發生率高,預后相對較差。研究也顯示,KRAS、BRAF突變的病人對抗EGFR靶向治療沒有效果,KRAS、BRAF散發型用抗EGFR靶向治療的效果相對要好。

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MSI/MMR

微衛星不穩定(MSI)是由錯配修復(MMR)基因發生缺陷引起的,當錯配修復系統功能異常時,微衛星出現的復制錯誤得不到糾正并不斷累積,使得微衛星序列長度或堿基組成發生改變。

目前推薦用于檢測微衛星不穩定的5個常用位點分別為BAT-25、BAT-26、D2S123、D5S346和D17S250。

  • 0個位點不穩定則稱為微衛星穩定(MSS);

  • 1個位點不穩定稱為微衛星低度不穩定(MSI-L);

  • 2個位點不穩定則稱為微衛星高度不穩定(MSI-H);

MSI-H的患者為dMMR,MSI-L和MSS的患者為pMMR

微衛星(MS)狀態與結腸癌臨床分期密切相關,II期結直腸癌中,MSI-H/dMMR約占20%,III期結直腸癌約占12%,IV期中約4%。

MS狀態在結腸癌中可以指導化療和指導預后

  • 多數研究結果提示MSI對結腸癌的預后作用與臨床分期密切相關。在II期結腸癌中,MSI-H/dMMR是預后良好的標志已達成共識

  • MS狀態在結腸癌輔助化療可預測療效作用。研究發現MSI-H的患者不能從單藥5-FU(5-氟尿嘧啶)的輔助化療中獲益;而MSI-L/MSS患者可明顯提高生存。

因此NCCN指南推薦既往患有直腸癌或結腸癌的所有個體都應進行MMR或MSI檢測、II期MSI-H患者預后較好,而且不能從5-FU輔助治療中獲益、對于II期結腸癌是否需要輔助化療,建議如為dMMR(錯配修復缺陷)或MSI-H(微衛星不穩定),不推薦氟尿嘧啶類藥物的單藥輔助化療

二、耐藥基因檢測

很多臨床試驗提示某些基因,例如PI3KCA、PTEN、HER2及SMAD4基因突變,可能與西妥昔單抗耐藥有關。

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PI3K基因

磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)是PIK3CA/AKT/mTOR信號通路的關鍵分子,PIK3CA/PIK3CB為PI3K的亞單位,研究表明其表達異常導致PI3K/AKT細胞信號通路的異常,在結直腸癌的發生發展中有重要的作用,其還與MDR1、MRP1介導的多藥耐藥存在密切聯系。有多項臨床回顧性研究證明PIK3CA基因突變的患者,西妥昔單抗療效低,反之療效高,但具體調控機制尚不清楚。

另外,PIK3CA的高表達還會導致傳統化療耐藥,并且與EGFR靶向治療密切相關。因為PIK3CA/AKT/mTOR信號通路是EGFR、FGFR和c-MET下游的信號通路,所以即使在上游阻斷EGFR(抗EGFR靶向治療),由于PIK3CA發生激活突變,仍然會激活下游的PIK3CA/AKT/mTOR,這種情況下使用抗EGFR治療療效肯定是差的。

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PTEN基因

PTEN是一個抑癌基因,可抑制PIK3CA活性。任何原因導致的PTEN缺失(甲基化、高甲基化、移碼突變、終止密碼子提前等),均可能導致其對PIK3CA/AKT/mTOR信號通路的抑制作用減弱,使得該信號通路較正常細胞活躍,進而影響到抗EGFR單克隆抗體的療效。遇到這種療效不佳的情況,如果我們能檢測到PTEN基因變異,就可以增加相應的抑制劑,再聯合抗EGFR單抗進行雙靶治療,改善患者生存

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HER-2基因

HER-2擴增或基因突變在接受抗EGFR單克隆抗體治療的NRAS、KRAS、BRAF野生型患者群體中常見,發生比例在3%左右,通常還會伴隨其他基因突變,會顯著影響抗EGFR單克隆抗體治療療效。

如果HER2存在突變,單用曲妥珠單抗(赫賽汀)無效,必須加上拉帕替尼,或者使用最新的HER2抗體-藥物偶聯物-DS8201a才會有效。所以目前針對于NRAS、KRAS、BRAF(三陰)野生型患者,還需要做一個常規的HER-2檢測。

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SMAD4基因

我們在臨床中發現,即使是NRAS、KRAS、BRAF(三陰)野生型的患者,只要攜帶SMAD4突變,即便是加上化療,使用EGFR單克隆抗體療效也特別差;如果SMAD4基因發生失活突變,不僅會對抗EGFR治療耐藥,還會加速腫瘤進展,后續治療選擇有限

綜上,在臨床診治過程中,我們需常規檢KRAS、BRAF、MSI/MMR基因的突變狀態,還會使用免疫組化常規檢測HER2蛋白表達情況。在懷疑患者耐藥時,除了常規檢測以上4種以外,還應盡可能地關注更多基因的突變狀態。

因此,對一些經濟條件比較好的患者,我們建議做一個大Panel的基因檢測,這將有助于發現可能影響抗EGFR療效的致病基因突變,也將更有利于對患者治療療效的預測、預后的判斷乃至后續的治療決策有更精準的判斷

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三、指導化療用藥基因

結直腸癌的基因檢測,除了眾所周知的靶向治療以外,其實還可以指導化療用藥。伊立替康和氟尿嘧啶(5-FU)是結直腸癌常用的化療藥物

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UGT1A1基因

證據級別最高的基因是UGT1A1,這個基因的多態性可以指導伊立替康用藥。現有研究結果表明UGT1A1*28等位基因的存在可導致伊立替康活性代謝產物SN-38的顯著增加,從而發生腹瀉/中性粒細胞減少的幾率顯著增加,因此建議該基因純合型患者每3周最大輸注伊立替康劑量降低至400mg

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DPYD基因

第二個基因是DPYD,該基因編碼的DPD酶是降解5-FU的一個關鍵酶、限速酶,體內80%的5-氟尿嘧啶由DPD酶代謝。目前發現,如果DYPD*2A、DYPD*13中相關的幾個位點發生突變,那么DPD酶活性喪失或減低,這類患者無法降解5-FU導致嚴重的化療毒副作用,甚至危及生命。所以,接受5-FU藥物治療的患者,需要考慮DPYD的基因狀態,并根據突變狀態給予合適的藥物劑量或者更換化療方案

總結

1.常規檢測KRAS、NRAS和BRAF,野生型患者可用西妥昔單抗,指導靶向治療

2.檢測PIK3CA、PTEN、HER2及SMAD4基因突變,可指導與西妥昔單抗耐藥治療

3. 檢測MSI/MMR,免疫治療藥物適合dMMR/MSI-H型患者,指導免疫治療;

4 UGT1A1、DPYD等基因的存在分別使伊立替康、5-FU毒副作用增加,指導化療藥物治療。

END


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